本庫是古聯（北京）數字傳媒科技有限公司系列古籍資料庫中的一個子系統，主要收錄來源為《海外中醫珍善本古籍叢刊》，透過數位化加工，提供圖書的版本對比功能；藏書印鑒皆可檢索；使用者中心功能完善，瀏覽、檢索皆有記錄，並可在當頁進行批注。

「四庫著錄書」約收書3,460 種，據總目補足所缺2書，另以文津閣補文淵閣刪削之書。 

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「四庫存目書」：此子庫收錄清修四庫時列為存目書4,755 種，是四庫著錄書之外對研究宋元明時期重要的材料。
「四庫奏毀書」：此子庫收錄約612種典籍，乃據清軍機處辦理銷毀奏摺編纂，是四庫著錄書之外對研究宋元明時期重要的材料。

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《四部叢刊》是二十世紀初由著名學者、出版家張元濟先生匯集多種我國古籍經典纂輯而成。該書共計收書477種3,134冊、近9,000餘萬字；最大特色是講究版本，是繼《四庫全書》後之另一古籍電子版鉅著。

本庫主要收錄曹炳章主編之《中國醫學大成》的149種醫書。《中國醫學大成》是曹炳章先生於1920年代約集名醫、遍覽群書，精選中醫典籍中的珍本、孤本、抄本進行整理，共同批校圈注、補闕正謬。該書採擇自先秦迄近代之中醫經典要籍，凡理論、方藥、臨床各科兼備，共分為十三類，包含：醫經、藥物、診斷、方劑、內科、外科（含傷科、眼科、五官）、婦科、兒科、針灸（含推拿、手術）、醫案、醫論、醫話等，書前皆有各醫家序及內容提要。曹炳章一生致力於中醫事業，為中醫古籍的保存和普及做出了巨大的貢獻。

本庫收錄清代流傳下來之方劑醫著，為目前存世之孤本、珍稀稿本、稀見抄本，共計289部。此庫不但豐富了中藥方劑方面相關內容，亦彌補了『初編』、『續編』前兩版本之遺缺。

本庫為中醫中藥古籍大系《續編》，其選題特點除了收錄明清兩朝官修和名醫所撰之經典醫書的注釋、衍義、新編、辯證、直解、精要、合編、補遺外，並收錄稀有中醫孤本，包括存世罕有的中醫文獻稿本、稀見抄本，共計126種。依據中醫傳統理論分為：醫經、診法、針灸、經絡、傷寒、溫病、本草、內科、外科、婦產科、兒科、喉科、眼科、養生、醫案、方劑、綜合、醫論、醫史。收錄內容不對原書做任何改動修飾，忠實呈現書籍原貌。

本庫為中醫中藥古籍大系《初編》，選錄中醫中藥最常用的經典著作共104部及日本醫書100部，如《黃帝內經》、《傷寒論》、《本草綱目》，以及中國歷史上最大的方劑書籍《普濟方》等，這些都是中醫中藥必備之書籍。

本資料庫以傅斯年圖書館收藏的拓片中挑選出中古時期佛教造像相關拓片建立而成，使用者可檢索題名、出土地點、收藏地和年代，也可以直接檢索釋文內容。

本庫是專題性的石刻文獻資料庫。本資料庫文、圖兼收，對原文進行標點、分段，並實現 全文檢索。全面收集、整合隋唐五代各類墓誌文獻，利用已經蒐集到的石刻拓片和已公開傳世古籍以及已經出版整理的古籍（如各類全集、金石誌等）等，不斷完善資料庫內容。