《中國譜牒庫》共收錄宋元明清歷代家譜7000餘種、年譜1200餘種、仕譜300餘種、日譜500餘種，共計1萬種。每種皆據善本製成保留原書所有訊息 (包括圖、表、標記在內)的數碼全文，逐頁對照原版影像，總計全文超過20億字，影像超過1千萬頁，資料總量約250G。同時配備檢索系統和功能平台，可 從分類檢索、條目檢索、全文檢索、高級檢索4條路徑進行快速海量檢索，可運用標點批註、分類管理、下載、全文列印等輔助功能。
目前採購初集，僅2,000種全文。

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《中國方志庫》收錄漢魏至民國歷代地方志類典籍，包括全國地理總志（如方輿志、一統志等），各地方志（如省通志、府州志、縣廳志等），各類專志（如山川志、邊防志、都城志、宮殿志、祠墓誌、園林志、寺觀志、書院志等），各種雜志（如鄉土志、物產志、風俗志、考古志、遊歷志等），以及外志（如環球志、一國志、多國志等），共計1萬種，分五集出版，目前出版至第二集。2010年採購第一集，2014年增購第二集，使用本資料庫前需先安裝軟體及完成設定。

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《中國基本古籍庫》是由中華文化所流傳的十餘萬種古籍當中，精選上自先秦下至民國的一萬餘種歷代典籍，除了提供重新輸入校對的全文內容，另外也收錄了該典籍的一至兩個重要版本的原文圖像，總計全文約二十億字，圖像約二千萬頁。

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資料庫內容包括經、史、子、集四部，其中以史部為主，經、子、集部為輔。若以類別相屬，又可略分為宗教文獻、醫藥文獻、文學與文集、政書、類書與史料彙編等，四十年來累計收錄歷代典籍已達一千四百八十六種，八億二仟三百五十三萬餘字，內容幾乎涵括了所有重要的典籍。

內閣大庫檔案內容多涉及一般行政事務，而許多案例並不見於會典或則例，是研究制度史的重要材料，同時對於社會史、經濟史或法制史等的研究也極具價值。

「史語所數位典藏資料庫整合系統」(IHP Digital Archives Online)含括本所歷年所建置之數位典藏成果，內容包含考古資料、漢代簡牘、金石拓片、善本古籍、印記、中國西南少數民族、內閣大庫檔案等12個資料庫，近76萬筆資料。藉由本系統，使用者可以進行跨資料庫查詢，一次查詢原本分散在各資料庫的內容，提升查詢的速度和方便性。使用者也可以針對單一資料庫進行更深入的進階查詢，在廣度及深度上皆能滿足不同查詢需求的使用者。另外，本系統也增加了若干工具，如查詢結果分析、會員收藏、影像比對、資料引用及輸出等，方便使用者進一步利用檢得的資料。

 收錄哈佛燕京圖書館典藏之中文善本古籍。

收錄東京大學東洋文化研究所所藏4630種漢籍善本的全文影像資料庫(其中611種為限定機構瀏覽)，可檢索。

收錄日本國立公文書館所藏列為重要文化財的南宋刊《廬山記》、南宋刊《東坡集》、南宋刊《史略》等12種漢文古籍之全文影像資料。